Genetic Engineering & Technology News：Ordaōs 使用 AI 生成治療用迷你蛋白
在迅速發展的藥物研發世界中，人工智慧 AI 的潛力仍然是一個引人注目但常常難以捉摸的概念，而一家新的公司正引起廣泛關注。Ordaōs，一家生成型AI公司，與眾不同的是其革命性的方法，特別是與Johnson & Johnson Innovation在JLABS @ NYC 的生態系統中的策略合作，在藥物領域是創新的代表。Ordaōs已經銜接了計算機模擬（in silico）和活體外（in vitro）實驗之間的鴻溝。與JLABS的合作關係為Ordaōs提供了三方面價值。首先，它使虛擬模擬到真實世界實驗之間形成一個無縫的循環，確保高生產量和高質量的數據生成。這個反饋循環使Ordaōs的AI引擎得到專有數據，從而進行加強培訓和持續改進。其次，實驗室空間通過提供量身定制的結合和功能性檢測來加速資產開發，這些檢測可以精確地針對特定的生物標誌物。這種以精確為驅動的方法大大縮短了潛在療法的開發所需的時間和資源。最後，這種合作從生物學的角度促進了技術創新。Ordaōs的首席科學官 Liang博士強調，進駐於JLABS的實驗空間加強了該公司推動其新型藥物設計方法的能力。這種方法以製造迷你蛋白為中心，這是一種與傳統抗體相比具有優勢的新領域。這些完全使用AI設計的迷你蛋白具有出色的穩定性、緊湊性和易於生產的特點。這代表了從傳統的製藥方法轉變的一個範例，傳統方法經常從功能性檢測開始，而缺乏Ordaōs方法所提供的精细見解。Ordaōs的首席執行官也表示同意，他認為該公司作為一個「資產鑄造廠」的角色使其能夠滿足生物技術和製藥合作夥伴的需求。Ordaōs的願景與其作為滿足未滿足需求的催化劑的角色保持一致，特別是在被忽略的罕見疾病領域，如三陰性乳癌和胰腺癌。Ordaōs對AI驅動的藥物研發的承諾與業內少數的創新者保持同步。Insilico Medicine是一個顯著的對手，同樣致力於基於AI的進步。然而，Ordaōs獨特的運營模式使其脫穎而出。與其他公司不同，該公司的方法涉及詳細的组成部分分析，確保在藥物開發過程中達到前所未有的透明度。這與製藥行業中傳統的「終極目標」方法形成鮮明對比，其中成功和失敗的信號經常是模糊的。Ordaōs的AI能力的核心在於其基於组成部分預測結果的能力。這使得該公司的生成型AI方法能夠識別細微的區別、潛在的障礙並修正其假設，從而實現更加速了解的藥物開發方法。其他基於AI的參與者也取得進展。Recursion Pharmaceuticals最近從Nvidia獲得了一筆重要的投資，而Insilico Medicine利用其專有的AI平台提交了新藥研究申請。Moderna與IBM合作利用生成型AI展示了這個領域的擴展視野。而 Ordaōs在迷你蛋白設計方面的策略具有其獨特的角度。
CureToday：生物標記用於早期檢測GVHD
尋求治療血癌的病患可能選擇接受幹細胞移植。但一個令人擔憂的副作用，即急性移植物抗宿主疾病(graft versus host disease，GVHD) 出現的可能性。GVHD是身體誤將自體健康細胞視為威脅並攻擊它們的狀況，這可能導致嚴重的症狀甚至病患死亡。識別出GVHD早期階段極具挑戰性，但至關重要。南卡羅來納州醫學大學 Hollings 癌症中心的研究員Sophie Paczesny強調了這一迫切性，她表示：「慢性GVHD的治療正在改進，但早期檢測仍然是最重要的。」該團隊的研究確定了三個與GVHD風險有關的生物標記，可以在移植後的90天內進行檢測，這比標準診斷方法要早得多。此發現基於2004年至2018年之間收集的1,000名病患的樣本，在此期間，一種新的治療方法PTCy已經顯出重要性。在這些生物標記中，有兩個與纖維化有關，這是在癌症晚期觀察到的組織硬化。這些標記包含：MMP3，一種在肺纖維化疾病中觀察到的酶；DKK3，已知可以促進纖維化。第三個生物標記顯示了CXCL9的存在，這是一種將免疫細胞吸引到受攻擊器官的蛋白質。儘管典型的GVHD診斷在90天左右預期會有更多的炎症標記，但這些生物標記物指向了早期組織再生指標。Paczesny 也提到DKK3的意外發現，它通常在明顯硬化病變進階GVHD階段才被識別出。GVHD的表現最初可能很輕微，如皮疹或眼睛乾燥，但可能加劇，導致呼吸困難或皮膚硬化。遺憾的是，這些症狀經常在較晚的階段才被檢測到。傳統的診斷依賴於明顯的臨床跡象，並由侵入性切片確認。然而，如《臨床研究雜誌》所述：傳統診斷檢測到的通常是已進階的纖維化病變，而不是這些新生物標記可以幫助揭示的早期徵兆。即使不能消除GVHD，這些發現確立了病人護理的基準，繼續尋找其他風險生物標記物至關重要，以完全對抗GVHD。Paczesny的未來計劃包括確定最容易得到GVHD的病人，並進入另一臨床試驗以提供專門的治療。這項研究象徵著向加強GVHD的早期檢測和治療邁出的重要步伐。